رئیس سازمان عقیدتی سیاسی وزارت دفاع با بیان اینکه اگر می‌گوییم شهید فخری زاده گمنام است به این دلیل است که بخش‌های مهمی از زندگی او برای مردم تبیین نشد، گفت: « ادیب و شاعر و مولوی شناس و حافظ شناس بود و در سپند (سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع) نیز محفل شعر برگزار می‌کرد».
سرلشکر باقری با بیان اینکه ما امروز طبق فرمایش مقام معظم رهبری دو وظیفه داریم، اظهار کرد: یک وظیفه مجازات آمران و عاملان این جنایت است که مسیرش را طی می‌کند و در زمان و مکان و نحوه‌ای که تشخیص و اقدام آن به دست رزمندگان است، اتفاق خواهد افتاد.
نشان درجه یک نصر امروز در مراسم بزرگداشت چهلمین روز شهادت شهید محسن فخری زاده باحضور رئیس ستاد کل نیرو‌های مسلح، وزیر دفاع، فرمانده کل ارتش و وزیر علوم به همسر این دانشمند برجسته هسته‌ای و دفاعی اهدا شد.
معاون هماهنگ کننده وزارت دفاع گفت: همه مقصران و دست‌اندرکاران ترور این شهید شناسایی شدند و اقدامات لازم برای دستگیری در حال انجام و انتقام سختی در انتظار جنایتکاران است و در زمان ممکن به سزای اعمالشان خواهند رسید.
صالحی رئیس سازمان انرژی اتمی گفت: در غنی سازی ۲۰ درصد وقتی مجلس قانون را تصویب کرد، خود را ملزم به اجرای قانون دانستیم. رئیس جمهور هم دستور تامین بخشی از نیازهای مالی قانون را در سال ۹۹ و غنی سازی ۲۰ درصد را دادند و ۲۰ درصد را بعد از طی کردن تشریفات آژانس ، به لحاظ فنی در مدت ۲۴ ساعت توانستیم راه بیندازیم و ساعتی ۱۷ تا ۲۰ گرم غنی سازی ۲۰ درصدی می شود و الان تولید و پایدار شده است.
سید حسن نصرالله گفت: دوست و دشمن بدانند ایران برای گرفتن انتقام شهیدانش به اصطلاح برخی‌ها از وکیلان یا دوستان یا عزیزان منطقه‌ای‌اش استفاده نمی‌کند. ترور شهید فخری‌زاده یک عملیات امنیتی بود و اگر ایران می‌خواست به آن پاسخ نظامی بدهد همان ساعت یا روز اول داده بود ولی ترور امنیتی باید پاسخ امنیتی بگیرد.»
عدم برخورد مناسب و قانونی با این جماعت که خود را در لوای حوزه و روحانیت پنهان کرده، کار را به جایی رساند که جمعه گذشته در بیانیه پایانی مراسمی که با عنوان گرامیداشت نهم دی و دهه بصیرت در قم برگزار شد، علاوه بر تهدید رئیس جمهوری به «زدن سیلی»، همه مشکلات و گرفتاری‌ها به حسن روحانی نسبت داده شد؛ از اف‌ای‌تی‌اف(FATF) تا ترور شهید فخری‌زاده؛ از توهین یک روحانی دیگر به رهبری تا واکسن کرونا و اختلاس و گرانی «سیب و گلابی»؛ از ترور سردار سلیمانی و برجام تا همه فتنه‌گری‌های داخلی و خارجی!
وزیر اطلاعات احمدی نژاد گفت: در خصوص شهادت شهید فخری زاده عامل ترور وابسته به رژیم صهیونیستی عملیات ترور را طراحی می‌کند و ۲ ماه قبل از اجرای عملیات از کشور خارج می‌شود.
سردار نقدی در سخنرانی به مناسبت روز 9 دی گفت: شوخی نیست که مسئولینی که مسئولیت‌های مختلفی را در دولت و مجلس و حتی قوه قضاییه برعهده داشتند طی ۲۴ سال قبل از آن، پشت سر یک جریان فتنه قرار گرفتند و گفتند که باید بازهم ما در رأس کار باشیم. در این میان آنها از تمام نمادها و شعارهای انقلاب استفاده کردند، از الله اکبر بالای پشت بام‌ها تا منصوب کردن خودشان به امام. برای در دست گرفتن قدرت؛ خب چه کسی است که نداند، فردی که بیشترین نزدیکی و قرابت با افکار و راه امام را دارد رهبر معظم انقلاب هستند و تک‌تک سلول‌های رهبری، فریاد خمینی سر می‌دهند.
آیت الله حسینی بوشهری رییس جامعه مدرسین گفت: بعضی از طلبه های ما درس خوان هستند اما زمان شناس نیستند و گاهی با یک موضع گیری نابجا، جامعه را بهم می‌ریزند.